سال ۱۳۷۰، در منطقه آزاد کیش، شرکت هواپیمایی کیش ایر در بخش خصوصی راه اندازی شد. در حال حاضر این شرکت هواپیمایی، عضو سازمان IATA بوده و دارای هفت فروند هواپیمای بوئینگ MD، دو فروند ایرباس A۳۲۰ و سه فروند هواپیمای فوکر ۱۰۰ است. کیش ایر، یکی از امن ترین هواپیمایی های کشور محسوب میشود که موفق به اخذ گواهینامه استاندارد ایمنی هواپیمایی IOSA شده است.

پروازهای خارجی این ایرلاین، در حال حاضر به مقاصدی چون ترکیه،عراق،دبی ، ابوظبی و… انجام می شود.